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forked from aurelient's block:

<!DOCTYPE html>
<head>
  <meta charset="utf-8">
  <script src="https://d3js.org/d3.v4.min.js"></script>
  <style>
    body { margin:0;position:fixed;top:0;right:0;bottom:0;left:0; }
     .province {
        fill: #000;
        stroke: #fff;
        stroke-width: 1px;
    }
    .province:hover {
        fill: #666;
    }
    .hidden {
        display: none;
    }
    div.tooltip {
        color: #222;
        background-color: #fff;
        padding: .5em;
        text-shadow: #f5f5f5 0 1px 0;
        border-radius: 2px;
        opacity: 0.9;
        position: absolute;
    }

</style>
</head>

<body>
  <script>
		var width = 960,
  		  height = 580;

var svg = d3.select( "body" )
  		.append( "svg" )
		  .attr( "width", width )
		  .attr( "height", height );

var g = svg.append( "g" ); 
    
    var projection =d3.geoConicConformal()
    								.center([2.454071, 46.279229])
    								.scale(2800);

var path = d3.geoPath() // d3.geo.path avec d3 version 3
                 .projection(projection);
    
    var tooltip = d3.select('body').append('div')
            .attr('class', 'hidden tooltip');
    
		
   /* d3.json("regions.json", function(json) {
	     svg.selectAll("path")
           .data(json.features)
           .enter()
           .append("path")
           .attr("d", path);

});*/
    
    var color = d3.scaleQuantize()
              .range(["rgb(237,248,233)", "rgb(186,228,179)",
                "rgb(116,196,118)", "rgb(49,163,84)", "rgb(0,109,44)"]);
    
    //var dataValue = parseFloat(data[i].somme2014);
    
    d3.csv("GrippeFrance2014.csv", function(data) {
      
      //color.domain([0,3000]);
      color.domain([
         d3.min(data, function(d) { return d.value; }),
         d3.max(data, function(d) { return d.value; })
      ]);

d3.json("regions.json", function(json) {
       
         //On fusionne les donnees avec le GeoJSON des regions
        for (var i = 0; i < data.length; i++) {
         //Nom de la region 
          //console.log(data[i].region);
         var dataState = data[i].region;

//Valeur associee a l'etat
         var moy_nov= (parseInt(data[i]["02/11/14"]) + parseInt(data[i]["09/11/14"]) 
                   + parseInt(data[i]["16/11/14"])+ parseInt(data[i]["23/11/14"])
                   + parseInt(data[i]["30/11/14"]))/5  
         
          // console.log(moy_nov) ;  
         var dataValue = moy_nov //parseFloat(data[i].somme2014); 
         
         //Recherche de l'etat dans le GeoJSON
 				 for (var j = 0; j < json.features.length; j++) {  
 				  	     var jsonState = json.features[j].properties.nom;
 					       if (dataState == jsonState) {
 					            //On injecte la valeur de l'Etat dans le json
 					            json.features[j].properties.value = dataValue;
 					            //Pas besoin de chercher plus loin
 					            break;
 				          }
         }
       }
        
         
         
       /* g.selectAll("path")
           .data(json.features) 
 					 .enter()
           .append("path") 
 					 .attr("d", path)
           .style("fill", function(d) {
                   var value = d.properties.value;  
                   //console.log( color(value) );       
                   if (value) {
 									    return color(value);
 				     	     } else { 
 							        // si pas de valeur alors en gris
 								       return "#ccc";
					         }
                 });*/
        
         var regions = svg.selectAll('.region')
                .data(json.features).enter();
            regions.append('path')
                .attr('class', function(d) { 
                     console.log(d.properties)
                    return 'region ' + d.properties.code;
                })
                .attr('d', path)
                 .style("fill", function(d) {
                   var value = d.properties.value;  
                   //console.log( color(value) );       
                   if (value) {
 									    return color(value);
 				     	     } else { 
 							        // si pas de valeur alors en gris
 								       return "#ccc";
					         }
                 })
                .on('mousemove', function(d) {
                    var mouse = d3.mouse(svg.node()).map(function(d) {
                        return parseInt(d);
                    });
                    tooltip.classed('hidden', false)
                        .attr('style', 'left:' + (mouse[0] + 15) +
                                'px; top:' + (mouse[1] - 35) + 'px')
                        .html(d.properties.nom+" : "+d.properties.value);
                })
                .on('mouseout', function() {
                    tooltip.classed('hidden', true);
                });
        
       });
   });
    
    
  </script>
</body>

https://d3js.org/d3.v4.min.js