Can't we all get along?

Another take on the SVG + Canvas Plot, but this time includes a third group of nodes: divs. Black nodes are drawn with HTML5 Canvas, blue nodes in SVG, and red nodes as divs. Zoomable and pannable.

<!doctype html>
<head>
  <title>can't we all get along?</title>
  <style>
    body { margin: 0; }
    svg, .divs {
      position: absolute;
      top: 0;
      left: 0;
    }
    rect { fill: transparent; }
    .divs div {
      border-radius: 50%;
      background: red;
      position: absolute;
    }
  </style>
  <script src='https://d3js.org/d3.v3.min.js'></script>
</head>
<body>
  <script type='text/javascript'>

/* SET UP ENV */

var map = {}, $circle, $div;
map.width = 960;
map.height = 500;

map.canvas =
  d3.select('body')
    .append('canvas')
      .attr('width', map.width)
      .attr('height', map.height)
      .node().getContext('2d');

map.svg =
  d3.select('body')
    .append('svg')
      .attr('width', map.width)
      .attr('height', map.height)
      .append('g');

map.svg.append('rect')
  .attr('class', 'overlay')
  .attr('width', map.width)
  .attr('height', map.height);

map.divs =
  d3.select('body')
    .append('div').attr('class', 'divs')
      .attr('style', function(d) { return 'width: ' + map.width + 'px; height: ' + map.height + 'px;'; });

/* PREPARE DATA and SCALES */

map.canvas.nodes =
  d3.range(100).map(function(d, i) {
    return {
      x: Math.random() * map.width / 2,
      y: Math.random() * map.height / 2,
      r: Math.random() * 10 + 3
    };
  });
map.svg.nodes =
  d3.range(100).map(function(d, i) {
    return {
      x: Math.random() * map.width / 2,
      y: Math.random() * map.height / 2,
      r: Math.random() * 10 + 3
    };
  });
map.divs.nodes =
  d3.range(100).map(function(d, i) {
    return {
      x: Math.random() * map.width / 2,
      y: Math.random() * map.height / 2,
      r: Math.random() * 10 + 3
    };
  });

map.nodes = map.svg.nodes.concat( map.canvas.nodes, map.divs.nodes );
var root = map.nodes[0];
root.r = 0;
root.fixed = true;

var x =
  d3.scale.linear()
    .domain([0, map.width])
    .range([0, map.width]);

var y =
  d3.scale.linear()
    .domain([0, map.height])
    .range([map.height, 0]);

/* PLOT */

map.canvas.draw =
  function() {
    map.canvas.clearRect(0, 0, map.width, map.height);
    map.canvas.beginPath();
    var i = -1, cx, cy;
    while (++i < map.canvas.nodes.length) {
      d = map.canvas.nodes[i];
      cx = x( d.x );
      cy = y( d.y );
      map.canvas.moveTo(cx, cy);
      map.canvas.arc(cx, cy, d.r, 0, 2 * Math.PI);
    }
    map.canvas.fill();
  };

map.svg.draw =
  function() {
    $circle =
      map.svg.selectAll('circle')
        .data(map.svg.nodes).enter()
        .append('circle')
          .attr('r', function(d) { return d.r; })
          .attr('fill', 'blue')
          .attr('transform', map.svg.transform);
  };

map.divs.draw =
  function() {
    $div =
      map.divs.selectAll('div')
        .data(map.divs.nodes).enter()
        .append('div')
          .attr('style', function(d) { return 'width: ' + (d.r * 2) + 'px; height: ' + (d.r * 2) + 'px; margin-left: -' + d.r + 'px; margin-top: -' + d.r + 'px;'; });
  };

map.canvas.draw();
map.svg.draw();
map.divs.draw();

map.redraw = function() {
  map.canvas.draw();
  $circle.attr('transform', map.svg.transform);
  $div.style('left', function(d) { return x(d.x) + 'px'; })
      .style('top', function(d) { return  y(d.y) + 'px'; });
};

map.svg.transform =
  function(d) {
    return 'translate(' + x( d.x ) + ',' + y( d.y ) + ')';
  };

/* FORCE */

var force =
  d3.layout.force()
    .gravity(0.05)
    .charge( function(d, i) { return i ? 0 : -2000; } )
    .nodes(map.nodes)
    .size([map.width, map.height])
    .start();

force.on('tick', function(e) {
  var q = d3.geom.quadtree(map.nodes), i;
  for (i = 1; i < map.nodes.length; ++i) {
    q.visit( collide(map.nodes[i]) );
  }
  map.redraw();
});

/* LISTENERS */

function mousemove() {
  var p = d3.mouse(this);
  root.px = x.invert( p[0] );
  root.py = y.invert( p[1] );
  force.resume();
}

d3.select('body')
  .on('mousemove', mousemove)
  .call( d3.behavior.zoom().x( x ).y( y ).scaleExtent([1, 8]).on('zoom', map.redraw) );

</script>
</body>

Modified http://d3js.org/d3.v3.min.js to a secure url

https://d3js.org/d3.v3.min.js